In Pacific Storm kommandiert der Spieler eine Flotte aus Kriegsschiffen, Flugzeugträgern, Zerstörern, Kreuzern, U-Booten und Torpedo-Booten sowie Tankern und Truppentransportern. Im Luftkrieg kann er Jäger (zuerst propellergetrieben, später auch mit Düsenantrieb), Fliegerabwehr, Torpedo- und Langstreckenbomber einsetzen.

Insgesamt verfügt der Spieler über 86 verschiedene Einheiten, die den Flugzeugen und Schiffen aus der Zeit des Zweiten Weltkriegs detailliert nachempfunden sind. Mit insgesamt etwa 100 technologischen Neuerungen kann im Verlauf des Spiels die Kampfkraft von Kriegsschiffen und Kampfflugzeugen ständig verbessert werden.

Zusätzlich zum Strategiemodus mit seinen 127 verschiedenen pazifischen Gebieten und 40 Marinestützpunkten kann der Spieler an 20 historischen Schlachten teilnehmen, darunter der Schlacht um Midway, den Abschuss des Flugzeugs des japanischen Admirals Yamamoto und die berühmte Schlacht von Pearl Harbour.