Für den jungen Schüler Yugi und seine Freunde dreht sich das ganze Leben um das mysteriöse Kartenspiel 'Duel Monsters'. Yugi ist für sein Alter ziemlich klein und oft dem Spott seiner Mitschüler ausgesetzt. Doch eines Tages ändert sich sein Leben: Yugis Großvater schenkt ihm das Millennium Puzzle, ein geheimnisumwittertes ägyptisches Medaillon, mit dem sich Yugi bei Gefahr in sein stärkeres und respekteinflößendes Alter Ego - Yu-Gi-Oh! - verwandeln kann.
Als Yu-Gi-Oh! wird er zum meisterhaften 'Duel Monsters'-Spieler und wird immer wieder von seinem Erzrivalen Kaiba zum Duell gefordert. Kaiba, ein verwöhnter Typ aus reichem Hause und Geschäftführer eines dubiosen High-Tech-Unternehmens, versucht Yugi und seinen Freunden das Leben schwer zu machen.
Doch Kaiba ist nicht die einzige Herausforderung für Yugi - ein dunkles Mysterium um das Millennium Puzzle wartet auf mit spannenden und nicht ganz ungefährlichen Abenteuern...

Das Herz der Karten:
Yugi und seine Freunde bewundern Großvaters Kartensammlung: Er besitzt ein Exemplar des seltenen 'Weissen Drachen mit dem eiskalten Blick'! Der undurchsichtige Kaiba, bisheriger Champion des Monsterduells, ist zu allem bereit, um diese Karte zu bekommen. Aber Yugi stellt sich Kaiba zum Kampf, und mit der Macht des Millennium Puzzles beschwört er im Duell das unbesiegbare Monster Exodia herauf .

Der erste Kampf mit Pegasus:
Yugi und seine Freunde sehen Weevil und Rex Raptor bei der Meisterschaft, die Weevil mit einer Insektenkarte für sich entscheidet. Pegasus fordert Yugi zum Duell in einer anderen Dimension, und dabei steht ein hoher Einsatz auf dem Spiel: Es geht um die Seele von Yugis Grossvater!

Der Verlust der Exodia
Yugi bekommt von Pegasus eine Einladung zu einem Duell im Königreich der Duellanten. Nur ausgewählte geladene Gäste werden an Bord eines Luxusliners dorthin gebracht. Yugi teilt seine beiden Einladungssterne mit Joey, der das Turnier unbedingt gewinnen muß: Nur so kann er eine Operation finanzieren, die seiner Schwester das Augenlicht retten soll.