Die Helden haben ihren ersten Auftrag erfüllt und die Cheerleaderin Claire Bennet vor dem Superschurken Sylar gerettet. Doch die Lügen, mit denen Claires Vater seine Tochter umgeben hat, drohen schon bald die gesamte Bennet-Familie zu zerstören. Währenddessen gelingt es Sylar, sich das Vertrauen des Genetikers Mohinder Suresh zu erschleichen und über den Wissenschaftler Zugang auf viele weitere Mutanten zu bekommen, denen er mit mörderischer Entschlossenheit die Superkräfte rauben will. Schließlich bemüht sich Peter Petrelli, seine eigenen Kräfte zu kontrollieren, bevor seine Vision wahr wird und er ganz New York dem Erdboden gleichmacht. Ein unheimlicher Mutant, der unerkannt unter den Menschen lebt, wird zu seinem Lehrmeister ...

Disc 1:
- Kontrollverlust
- Ablenkungen
- Flucht
- Unerwartet

Disc 2:
- Die Firma
- Parasit
- 0,07 Prozent
- Fünf Jahre später

Disc 3:
- Der schwierige Teil
- Erdrutsch
- Wie man einen explodierenden Mann aufhält