Bei Metroid: Zero Mission ist dies ebenso. Das Spiel führt uns zurück auf den Planeten Zebes und zu Samus´ erster Begegnung mit den Metroiden. Diese Version des originalen NES-Spiels wurde allerdings so sehr überholt und verbessert, dass sie kaum noch wiederzuerkennen ist. Samus wird nach Zebes gesandt, um Gerüchten über eine neue Alien-Spezies auf den Grund zu gehen. Es handelt sich um eine Spezies, die nur das Eine im Sinn haben soll: Zerstörung und Verwüstung. Als sie ankommt, wird aus den Gerüchten schnell schreckliche Gewissheit: Die Metroiden verströmen Blasen, die einem in Sekundenschnelle die Energie entziehen. Die Brut eines riesigen, aufgeblähten Hirns gedeiht irgendwo unter der Oberfläche des Planeten. es gibt ein brandneues Ende, das man gesehen haben muss, um es zu glauben. Metroid: Zero Mission darf man einfach nicht verpassen.