Star Wars: Episode I Die Dunkle Bedrohung versetzt Sie in die Rollen der wichtigsten Charaktere des Films: Jedi-Ritter Obi-Wan Kenobi, Jedi-Meister Qui-Gon Jinn, Königin Amidala und Captain Panaka. Genau wie der Film beginnt das Spiel in einer Galaxis, die von Unruhen erschüttert wird. Obi-Wan und Qui-Gon wurden zu dem Planeten Naboo entsandt, um eine drohende Blockade der Handelsrouten durch die habgierige Handelsföderation abzuwenden. Bei ihrer Ankunft merken die Jedi schnell, dass sie in eine Falle gelockt wurden und ihr Leben in Gefahr ist. Der Kampf zur Rettung der Republik vor einer unheilvollen Bedrohung beginnt.